La Cámara de Compensación es una oficina de la Bolsa, de acceso reservado a la Gerencia y personal autorizado, en la que mantendrá el archivo de instrumentos, documentación vinculada con las operaciones, los datos y posiciones de los compradores y vendedores. Asimismo, le corresponde administrar las garantías generales, especiales, márgenes o diferencias y la cuenta bancaria de terceros, totalmente segregada de los fondos patrimoniales de la Bolsa.

La importancia de este órgano estriba en que es el encargado de procurar el cumplimiento por parte de los Puestos de Bolsa, de los compromisos que hayan adquirido en virtud de los contratos que concierten. Para ello, sólo librará el cheque u orden de pago a favor del cliente del Puesto vendedor, con débito a la cuenta BAISA-CUENTA DE TERCEROS- NEGOCIACION, después que el cliente del Puesto comprador haya depositado los fondos y se haya producido la entrega de la mercadería por parte del vendedor a conformidad del comprador.